Зеленушки предпочитают негустые леса с развитым подростом, в первую очередь еловым. На приусадебных участках с удовольствием гнездятся в можжевельниках, туях и других густых хвойных деревцах, интродуцированных в наши сады и парки. Птицы, остающиеся на зиму, держатся на пустырях и заросших полях, где в изобилии растут высокие сорняки, торчащие над снежным покровом. Посещают они и кормушки для зимующих птиц, развешанные в парках и других местах. Питаются зеленушки преимущественно семенами травянистых растений, поэтому они чаще поселяются вблизи пустырей и неухоженных газонов, где буйно разрастаются сорняки. Песня зеленушки не отличается особой мелодичностью, исполняется неторопливо и напоминает пение плохой канарейки или чижа. Сначала исполняется трель «вид-вид-вид-вед-вед, вюд-вюд, гиррр», затем вставляется очень характерное, картавое «жжжи-и-и» и снова «вид-вид, вюд-вюд».
В Санкт-Петербурге зеленушки гнездятся во многих парках и скверах, где имеются посадки ели и туи. Такие условия имеются и в Ботаническом саду СПБГУ, где зеленушки регулярно гнездятся. Первые гнезда появляются уже в апреле, последние кладки в Санкт-Петербурге и Ленинградской области отмечены в третьей декаде июля. Такой длительный срок размножения объясняется тем, что многие пары выводят птенцов дважды. Строят гнездо самки в потаенном месте, как правило, у ствола на небольшой высоте. В местах сильного беспокойства и большого числа хищников постройки располагаются выше, от 4 до 6 метров. Толстые стенки гнезда сплетаются из тонких веточек, мха, травы, растительного пуха. Лоток выстилается шерстью, корешками, перьями, иногда используются синтетические мягкие материалы. Кладку из 5 — 6 голубоватых в пятнышках яиц насиживает тоже самка. Заботливый самец подкармливает подругу. Вылупившихся птенцов зеленушки выкармливают почти исключительно растительной пищей, семенами сорных растений, в то время как большинство родственников приносят птенцам мелких насекомых. Через 12 — 15 дней после вылупления птенцы покидают гнездо, а самка в это время уже может насиживать вторую кладку. Самец продолжает кормить подросших детей не забывая покормить и самку. Когда молодые подрастут, зеленушки сбиваются в стайки и начинают кочевать в поисках кормных участков. В это время они едят семена малины, ирги, рябины, доставая их из висящих ягод.
Зеленушки встречаются у нас в течение всего года, но зимой их заметно меньше. Часть птиц откочевывает южнее, в соседние области.